L'area marina protetta dell'atollo di Mnemba, istituita nel 1997, protegge un raggio di 500 metri di barriera corallina che si eleva dal fondale dell'Oceano Indiano a otto chilometri dalla costa nord-orientale di Unguja. La laguna poco profonda dell'atollo raggiunge solo sei metri con l'alta marea, creando una nursery protetta dove pesci pappagallo gobbi e tartarughe verdi brucano le praterie marine indisturbate dalle correnti. Il Ministero dell'Agricoltura, delle Risorse Naturali, del Bestiame e della Pesca di Zanzibar ha designato la zona dopo che la pesca con dinamite ha distrutto il 40 percento dei coralli dell'arcipelago tra il 1985 e il 1995. Oggi, 220 specie di pesci della barriera corallina registrate nelle indagini di base tornano a deporre le uova lungo la parete settentrionale dell'atollo. I charter privati per il tour di Mnemba Island operano con permessi rilasciati dall'Unità di Conservazione Marina di Zanzibar, che limita gli ingressi giornalieri a 16 barche per prevenire danni da ancora. Ogni charter paga una tassa di conservazione marina di 25 USD per ogni visitatore adulto non dell'Africa orientale, fondi distribuiti agli equipaggi di pattuglia e alla manutenzione delle boe di ormeggio. L'atollo si trova all'interno dell'ombra del vento monsonico di nord-est da novembre a febbraio, quando la visibilità superficiale raggiunge i 30 metri e i delfini stenella si spostano sottocosta per riposare sottovento alla barriera. I capitani dei charter navigano tramite GPS verso tre siti di ormeggio permanenti installati nel 2014, eliminando la necessità di ancore che danneggiano la barriera. Il fascino di Mnemba risiede nella sua densità ecologica piuttosto che nelle sue dimensioni. L'atollo misura 2,5 chilometri di circonferenza, eppure i suoi assemblaggi corallini includono 40 specie di corallo duro registrate e otto famiglie di corallo molle. Gli snorkelisti che entrano all'ormeggio sud-occidentale incontrano coralli tabulari Acropora colonizzati da pesci damigella, seguiti da ammassi di corallo a cervello dove le murene si riparano nelle fessure. La faccia nord-occidentale scende verso un canale sabbioso a dieci metri, un corridoio utilizzato dai tursiopi durante i transiti mattutini. La maggior parte degli esclusivi tour di snorkeling a Zanzibar programma le partenze tra le 07:00 e le 09:00, arrivando prima che i venti pomeridiani kaskazi increspino la superficie e prima dell'afflusso di barche di metà giornata. La componente terrestre dell'atollo, la stessa Mnemba Island, rimane chiusa ai visitatori giornalieri. L'isola privata di 1,5 ettari opera come lodge di conservazione con siti di nidificazione sulla spiaggia per le tartarughe embricate monitorati secondo un accordo di gestione della fauna selvatica di 20 anni firmato nel 2003. Le barche charter mantengono una zona di esclusione di 200 metri attorno al livello dell'alta marea dell'isola, assicurando che le attività di snorkeling si concentrino sulla barriera aperta piuttosto che sulle zone vicino alla riva. Questa separazione spaziale consente all'atollo di funzionare sia come risorsa turistica che come riserva marina funzionale, un modello che il Piano Spaziale Marino di Zanzibar ha esteso a sei siti aggiuntivi nel 2021.